Cara mengubah daftar nomor CAS dan nama IUPAC menjadi SMILES sekaligus [Perangkat lunak bebas]

2018 12 年 月 日 9

Ada banyak situs yang mengeluarkan SMILES ketika Anda memasukkan nomor CAS (CAS No.) atau Nama IUPAC untuk satu senyawa, tetapi jika daftarnya banyak, Anda harus memasukkannya satu per satu dan mengonversinya.Pada artikel ini, saya akan memperkenalkan metode untuk mengonversi kumpulan notasi majemuk yang berisi ribuan unit menjadi SMILES atau InChI Key.

Apa itu ChemCell

ChemCell adalah makro yang dapat mengubah nama kimia dan nomor CAS menjadi string SMILES di Microsoft Excel.Notasi majemuk yang dapat dikonversi antara lain:

  • Nomer CAS.
  • SMILES
  • Kunci InChI
  • nama IUPAC

Unduh ChemCell.dll

sel kimiaBuka halaman GitHub dari "mengunduh ChemCell" dan pilih "Klon atau Unduh" → "Unduh zip".

 

使 い 方

Ekstrak file zip dan buka chemcell.xls.Jika makro tidak diaktifkan, klik Pusat Kepercayaan > Pengaturan Pusat Kepercayaan > Pengaturan Makro dan aktifkan makro.Yang harus Anda lakukan adalah menentukan sel yang berisi notasi majemuk yang akan dikonversi dan masukkan fungsi berikut.

=dapatkanSENYUM()

Keluaran SMILES dari IUPAC Name dan CAS No.

=getInChIKey()

Output InChIKey dari IUPAC Name, CAS No., dan SMILES.

mencoba untuk mengkonversi

Saya akan mencobanya dengan benzena. Dalam PubChem, notasi senyawa benzena dijelaskan sebagai berikut.

Nama IUPAC: Benzene CAS: 27271-55-2 SMILES: c1ccccc1 InChIKey: UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N

Output di chemcell.xls adalah sebagai berikut, dan telah dikonversi dengan benar.

Ngomong-ngomong, saat mengonversi daftar ribuan senyawa, butuh waktu sekitar puluhan menit karena pemrosesan.

struktur

https://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure/ 「化合物の構造識別子」 / 「出力したい表現」

Mekanisme ChemCell sederhana, dan layanan konversi notasi struktur kimia online dari US National Cancer InstitutePemecah Pengenal Kimia" sedang dipakai. Di Penyelesai Pengenal Kimia, jika Anda memasukkan Nama IUPAC, No. CAS, dll. di bagian tertentu dari URL, itu akan mengembalikan notasi rumus struktur lain yang sesuai.Hasil keluaran ChemCell tampaknya dapat diandalkan sampai batas tertentu karena melalui layanan yang dioperasikan oleh lembaga penelitian nasional biasa.