Comment convertir une liste de numéros CAS et de noms IUPAC en SMILES à la fois [Logiciel gratuit]
Il existe de nombreux sites qui produisent des SMILES lorsque vous entrez le numéro CAS (CAS No.) ou le nom IUPAC d'un composé, mais s'il y a plusieurs listes, entrez-les une par une pour les convertir. C'est impossible.Dans cet article, je vais vous montrer comment convertir par lots une liste de notations composées contenues dans des milliers d'unités en SMILES ou InChI Key.
Qu'est-ce que ChemCell?
ChemCell est une macro qui permet à Microsoft Excel de convertir les noms chimiques et les numéros CAS en chaînes SMILES.Les notations composées convertibles sont les suivantes.
- N ° CAS.
- Nos
- InChI Key
- Nom IUPAC
Télécharger ChemCell
Cellule ChemAccédez à la page GitHub à partir de "télécharger ChemCell" de, et vous pouvez l'obtenir à partir de "Cloner ou télécharger" → "Télécharger zip".
使い方
Décompressez le fichier zip et ouvrez chemcell.xls.Si la macro n'est pas activée, cliquez sur Centre de sécurité> Paramètres du centre de sécurité> Paramètres des macros pour activer la macro.Tout ce que vous avez à faire est de spécifier la cellule contenant la notation composée à convertir et d'entrer la fonction suivante.
= getSMILES ()
Sorties SMILES à partir du nom IUPAC et du numéro CAS
= getInChIKey ()
InChIKey est généré à partir du nom IUPAC, du numéro CAS et de SMILES.
Convertir en fait
Je vais l'essayer avec du benzène. Dans PubChem, la notation composée du benzène est la suivante.
Nom IUPAC: Benzène CAS: 27271-55-2 SMILES: c1ccccc1 InChIKey: UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N
La sortie suivante est sortie dans chemcell.xls et la conversion est correcte.
À propos, lors de la conversion d'une liste de milliers de composés, il a fallu plusieurs dizaines de minutes en raison du traitement.
仕 組 み
https://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure/ 「化合物の構造識別子」 / 「出力したい表現」
Le mécanisme de ChemCell est simple, le service en ligne de conversion de notation de structure composée du National Cancer Institute "Résolveur d'identifiant chimiqueEst utilisé. Dans Chemical Identifier Resolver, si vous entrez le nom IUPAC, le numéro CAS, etc. dans une certaine partie de l'URL, la notation de formule structurelle correspondante sera renvoyée.Puisqu'il s'agit d'un service géré par un institut de recherche national régulier, il semble que le résultat de sortie de ChemCell puisse être utilisé avec une certaine fiabilité.