在Open babel，Pybel和RDkit之间转换以处理mol文件
RDkit，Open Babel和Pybel是在Python中进行化学信息学必不可少的库。所有库都可以执行分子运算和描述符生成以进行机器学习，但是有些运算只能用该程序包完成，或者可以更轻松地实现。
基本上，从将化合物转换为mol对象开始执行各种操作。当然，在每个库中创建的mol对象不能被另一个库读取，因此需要对其进行转换。
从Open Babel转换为Pybel
从Openbabel的摩尔到Pybel的摩尔有一个专用的转换模块。
＃从Smiles中创建openbabel格式mol导入openbabel obConversion.SetInFormat（“ smi”）obmol = openbabel.OBMol（）obConversion.ReadString（obmol，“ C1 = CC = CS1”）
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使用#Molucule（）将Openbabel mol转换为pybel mol import pybel pybelmol = pybel.Molecule（obmol）pybelmol
从Open Babel，Pybel到RDkit的转换
将Open Babel或Pybel的mol输出为SDF文件，然后使用RDkit读取。反向路由也通过SDF进行。
从rdkit导入Chem pybelmol.write（“ sdf”，“ outputfile.sdf”）rdmol = Chem.SDMolSupplier（'outputfile.sdf'）rdmol