Lista dimensional de descritores moleculares
O que é um descritor molecular?
Um valor numérico que expressa as características da molécula com base em sua estrutura química.O tipo de descritor é dividido em 0-4 dimensões dependendo do espaço composto considerado ao calcular o descritor.
Lista de descritores por número de dimensões
| Número de dimensões | descritor | Exemplo concreto |
| 0D | Descritor de configuração Descritor de contagem |
Peso molecular, número de ligações Número atômico de C, H, O, N, etc. |
| 1D | Número de fragmentos Impressões digitais |
Número de contagem e presença / ausência (0 ou 1) de uma subestrutura específica -CH3, -OH, -NH2, -COOH -CH2-, -CH2-CH2- ... etc. |
| 2D | Descritor topológico (Índice topológico, índice de conectividade) |
Índice Balaban J, índice de Zagreb, índice de Wiener, Índice de conectividade Chi, índice de forma kappa, BCUT |
| 3D | Descritor de geometria (Descritor geométrico) |
Descritores 3D-MoRSE Descritores WHIM Descritores GETAWAY Descritores químicos quânticos descritores de tamanho, estérico, de superfície e de volume, etc. |
| 4D | Energia de interação | Amostragem de coordenadas 3D + conformação. Grid, CoMFA, Volsurf |
Imagem em 0-3 dimensões
A imagem a seguir é fácil de entender.Esta é uma lâmina do laboratório (Chemometrics and QSAR Research Group) da Universidade de Estrasburgo, França.
Fonte:http://infochim.u-strasbg.fr/CS3/program/material/Todeschini.pdf
Descritor 0D
Os descritores moleculares 0D também são chamados de descritores constitucionais e descritores de contagem.
Incluindo o peso molecular, a contagem de certos átomos na molécula (C, H, O, N, halogênio, o número de anéis, o número total de átomos pesados, etc.), o número de ligações rotativas, o número de 2 (ou 3) ligações duplas, etc. Valores que podem ser obtidos a partir da fórmula molecular são listados.
Descritor 1D
Um grupo de descritores que contam grupos funcionais específicos e subestruturas (= número de fragmentos) e expressam sua presença ou ausência por 0 e 1 (= impressão digital).
Os grupos funcionais alvo e estruturas parciais incluem carbonos primários, secundários e terciários, carbonos terminais e internos, grupos hidroxi, grupos amino, grupos amida, grupos imino, ácidos carboxílicos, tióis, anéis de benzeno, anéis aromáticos, etc.
O número de átomos doadores e aceitadores de ligações de hidrogênio e valores de propriedades físicas como vários LogPs (AlogP, ClogP, SlogP, XlogP, etc.) também estão incluídos no descritor unidimensional.
Descritor 2D
Um descritor bidimensional inclui um descritor topológico.Também é chamado de índice topológico ou índice de conectividade.O professor Haruo Hosoya, professor emérito da Universidade Ochanomizu, é conhecido como o inventor.
Um composto descritor topológico é um valor calculado como um invariante de um composto como uma estrutura de gráfico e seu gráfico molecular.
Exemplo:
Índice de Wiener: soma das distâncias mais curtas entre certos átomos em uma molécula
Área da Superfície Polar Topológica (TPSA): A área da parte polar da superfície molecular. Um cálculo aproximado de alta velocidade de PSA que requer uma estrutura tridimensional.
O cálculo aproximado de informações 2D a partir de informações 3D, como TPSA, também é chamado de descritor 2.5D e uma parte do descritor 3D também se aplica a isso.
Descritor 3D
O descritor tridimensional é um valor calculado com base na estrutura tridimensional do composto. Uma estrutura 3D precisa é necessária para calcular o descritor 3D.
Um gráfico molecular que pondera os valores calculados a partir de cálculos de química quântica (níveis de energia HOMO / LUMO, etc.) e as coordenadas tridimensionais de x, y e z de acordo com as características de cada átomo é colocado, e os correspondentes matriz molecular .Os valores próprios calculados são usados.
Descritor 4D
Um descritor definido por meio da interação com outros compostos, como energia de interação. É obtido a partir do método Grid, CoMFA, Volsurf, etc.
Classificação dimensional de descritores
この記述子の次元は英語版wikiで0-4次元では0-3次元、RDkitやPaDEL‐descriptorでは1＆2と3次元に分類されており、分類の仕方も様々です（Grid, CoMFA, Volsurfを3次元としているところもありました）。出典やソフトにより違いがありますが、運用上はSMILESからも計算できる0-2次元以内の記述子と立体構造情報が必要な3次元以上に大別して考えればよいのではないかと思います。
referência
・ Wiki em inglês https://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_descriptor
・ Tópico ScienceDirect https://www.sciencedirect.com/topics/medicine-and-dentistry/molecular-descriptor
·http://infochim.u-strasbg.fr/CS3/program/material/Todeschini.pdf