Cách chuyển đổi danh sách số CAS và tên IUPAC thành SMILES cùng một lúc [Phần mềm miễn phí]
Có nhiều trang web xuất ra SMILES khi bạn nhập số CAS (Số CAS) hoặc Tên IUPAC cho một hợp chất, nhưng nếu có nhiều danh sách, bạn phải nhập từng danh sách một và chuyển đổi.Trong bài viết này, tôi sẽ giới thiệu một phương pháp để chuyển đổi hàng loạt danh sách các ký hiệu ghép chứa hàng nghìn đơn vị sang SMILES hoặc InChI Key.
Hóa chất là gì
ChemCell là một macro có thể chuyển đổi tên hóa chất và số CAS thành chuỗi SMILES trong Microsoft Excel.Các ký hiệu ghép có thể được chuyển đổi bao gồm:
- Số CAS
- SMILES
- Khóa InChI
- tên IUPAC
Tải xuống ChemCell
tế bào hóa họcTruy cập trang GitHub từ "tải xuống ChemCell" và chọn "Sao chép hoặc Tải xuống" → "Tải xuống zip".
使 い 方
Giải nén tệp zip và mở chemcell.xls.Nếu macro không được bật, hãy bấm vào Trung tâm tin cậy > Cài đặt Trung tâm tin cậy > Cài đặt macro và bật macro.Tất cả những gì bạn phải làm là chỉ định ô chứa ký hiệu ghép sẽ được chuyển đổi và nhập hàm sau.
=getSMILES()
Xuất SMILES từ Tên IUPAC và Số CAS.
=getInChIKey()
Xuất InChIKey từ Tên IUPAC, Số CAS và SMILES.
cố gắng chuyển đổi
Tôi sẽ thử nó với benzen. Trong PubChem, ký hiệu hợp chất của benzen được mô tả như sau.
Tên IUPAC: Benzen CAS: 27271-55-2 CƯỜI: c1ccccc1 InChIKey: UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N
Đầu ra trong chemcell.xls như sau và nó đã được chuyển đổi chính xác.
Nhân tiện, khi chuyển đổi một danh sách hàng nghìn hợp chất, sẽ mất khoảng hàng chục phút do quá trình xử lý.
kết cấu
https://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure/ 「化合物の構造識別子」 / 「出力したい表現」
Cơ chế của ChemCell rất đơn giản và dịch vụ chuyển đổi ký hiệu cấu trúc hóa học trực tuyến của Viện Ung thư Quốc gia Hoa KỳBộ phân giải định danh hóa học" đang được sử dụng. Trong Trình phân giải định danh hóa học, nếu bạn nhập Tên IUPAC, Số CAS, v.v. vào một phần nhất định của URL, nó sẽ trả về một ký hiệu công thức cấu trúc tương ứng khác.Kết quả đầu ra của ChemCell dường như đáng tin cậy ở một mức độ nào đó bởi vì nó thông qua một dịch vụ được vận hành bởi một viện nghiên cứu quốc gia thông thường.